主要指遗传物质(染色体、DNA)发生改变而导致的肥胖，这种肥胖极为罕见，常有家族性肥胖倾向。肥胖症的发病率突出表现为三个阶段：婴幼儿期、青春发育期、40岁以上成年期。婴幼儿期及青春期的患者，绝大多数可以发展成为成年肥胖症，而且肥胖程度较重。

父母双方肥胖的情况下，下一代肥胖的概率比非家族遗传肥胖的要高出70%;父母一方肥胖的情况下，下一代肥胖的概率比非家族遗传肥胖的要高出30%。从以上数据看，遗传性肥胖确实是有较高的肥胖可能，肥胖也不是100%遗传。