为了使柠檬更加透亮更加吸引到顾客的眼球，商家们会在柠檬上镀层蜡，使柠檬看起来鲜亮好看。所以在制作柠檬蜂蜜水时，可先在干燥的柠檬表面上洒一层盐，然后揉搓掉柠檬皮上的蜡然后再用清水洗净。
根据不同的柠檬蜂蜜水的制作方法，很多人的新鲜柠檬在切片后用保鲜膜包着放入冰箱保存，有的放冰箱保存时间甚至超过一周，其实这样的保存方式会不知不觉的让柠檬流失其营养价值。新鲜柠檬切片后放入冰箱保存时间不宜超过一周，但把柠檬放入蜂蜜中就可以长时间保存了。所以新鲜柠檬做法需要尽快的喝完。