蛲虫病是儿童时期常见的一种寄生虫病，由于蛲虫刺激幼儿肛门就会引起肛门痒。蛲虫病会经常引起宝宝肛门痒，使宝宝睡眠不好，精神不佳，时间久后宝宝抵抗力下降，容易感染其它疾病。蛲虫病还会刺激宝宝肠粘膜，使小儿出现恶心、呕吐、腹泻、腹痛等症状。如果发现小儿患有蛲虫病应该立即去医院就诊治疗。
蛔虫病是蛔虫引起的一种肠道疾病，也是小儿时期最常见的一种肠道寄生虫病。蛔虫对小儿身体有很大的伤害，早期症状主要表现在肛门痒，如果不及时治疗中期还会发生干咳、发热、哮喘、荨麻疹等症状，后期蛔虫会乱串乱动，引起胆道蛔虫症等疾病。
原发性胆汁性肝硬化或胆道梗阻的患者会由于血液和皮肤里的胆盐含量过高，刺激人体神经末梢，导致肛门痒；对于肾病后期的尿毒症患者也能够引起肛门痒。
内分泌系统疾病也可以引起肛门痒，例如糖尿病患者含糖量增高，刺激神经末梢导致肛门痒；甲状腺功能亢进症也会导致肛门皮肤痒，甲状腺功能亢进主要与多汗、基础代谢率增高、情绪紧张等因素有关。
肛门、直肠、肛管、结肠和小肠疾病会使肛门过度潮湿，分泌物增加，刺激肛门，使肛门出现痒的症状。引起肛门痒的疾病一般包括肛瘘、肛裂、内痔脱出、直肠脱垂、肛门失禁、湿疣等。
肛门处皮肤感染诱发皮肤病也会导致肛门痒。常见的皮肤病有霉菌性感染，神经性皮炎，毛囊炎、脂质性皮肤。对于这类型的皮肤病要注意经常经常清洗肛门处，预防诱发其他类疾病感染。